通用数据模型解决了标准化电子健康记录(EHR)数据的许多挑战,但无法将其集成深度表型所需的资源。开放的生物学和生物医学本体论(OBO)铸造本体论提供了可用于生物学知识的语义计算表示,并能够整合多种生物医学数据。但是,将EHR数据映射到OBO Foundry本体论需要大量的手动策展和域专业知识。我们介绍了一个框架,用于将观察性医学成果合作伙伴关系(OMOP)标准词汇介绍给OBO铸造本体。使用此框架,我们制作了92,367条条件,8,615种药物成分和10,673个测量结果的映射。域专家验证了映射准确性,并且在24家医院进行检查时,映射覆盖了99%的条件和药物成分和68%的测量结果。最后,我们证明OMOP2OBO映射可以帮助系统地识别可能受益于基因检测的未诊断罕见病患者。
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尽管电子健康记录是生物医学研究的丰富数据来源,但这些系统并未在医疗环境中统一地实施,并且由于医疗保健碎片化和孤立的电子健康记录之间缺乏互操作性,可能缺少大量数据。考虑到缺少数据的案例的删除可能会在随后的分析中引起严重的偏见,因此,一些作者更喜欢采用多重插补策略来恢复缺失的信息。不幸的是,尽管几项文献作品已经通过使用现在可以自由研究的任何不同的多个归档算法记录了有希望的结果,但尚无共识,MI算法效果最好。除了选择MI策略之外,归纳算法及其应用程序设置的选择也至关重要且具有挑战性。在本文中,受鲁宾和范布伦的开创性作品的启发,我们提出了一个方法学框架,可以应用于评估和比较多种多个插补技术,旨在选择用于计算临床研究工作中最有效的推断。我们的框架已被应用于验证和扩展较大的队列,这是我们在先前的文献研究中提出的结果,我们在其中评估了关键患者的描述符和Covid-19的影响在2型糖尿病患者中的影响,其数据为2型糖尿病,其数据为2型糖尿病由国家共同队列合作飞地提供。
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图表学习方法为解决图形所代表的复杂的现实世界问题打开了新的可能性。但是,这些应用程序中使用的许多图包括数百万节点和数十亿个边缘,并且超出了当前方法和软件实现的功能。我们提供葡萄,这是一种用于图形处理和表示学习的软件资源,能够通过使用专业和智能数据结构,算法和快速并行实现来通过大图扩展。与最先进的软件资源相比,葡萄显示出经验空间和时间复杂性的数量级的改善,以及边缘预测和节点标签预测性能的实质和统计学上的显着改善。此外,葡萄提供了来自文献和其他来源的80,000多种图,标准化界面允许直接整合第三方库,61个节点嵌入方法,25个推理模型和3个模块化管道,以允许公平且可重复的方法比较以及用于图形处理和嵌入的库。
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Deep learning-based pose estimation algorithms can successfully estimate the pose of objects in an image, especially in the field of color images. 6D Object pose estimation based on deep learning models for X-ray images often use custom architectures that employ extensive CAD models and simulated data for training purposes. Recent RGB-based methods opt to solve pose estimation problems using small datasets, making them more attractive for the X-ray domain where medical data is scarcely available. We refine an existing RGB-based model (SingleShotPose) to estimate the 6D pose of a marked cube from grayscale X-ray images by creating a generic solution trained on only real X-ray data and adjusted for X-ray acquisition geometry. The model regresses 2D control points and calculates the pose through 2D/3D correspondences using Perspective-n-Point(PnP), allowing a single trained model to be used across all supporting cone-beam-based X-ray geometries. Since modern X-ray systems continuously adjust acquisition parameters during a procedure, it is essential for such a pose estimation network to consider these parameters in order to be deployed successfully and find a real use case. With a 5-cm/5-degree accuracy of 93% and an average 3D rotation error of 2.2 degrees, the results of the proposed approach are comparable with state-of-the-art alternatives, while requiring significantly less real training examples and being applicable in real-time applications.
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黑色素瘤是一种严重的皮肤癌,在后期阶段高死亡率。幸运的是,当早期发现时,黑色素瘤的预后是有希望的,恶性黑色素瘤的发病率相对较低。结果,数据集严重不平衡,这使培训当前的最新监督分类AI模型变得复杂。我们建议使用生成模型来学习良性数据分布,并通过密度估计检测出分布(OOD)恶性图像。标准化流(NFS)是OOD检测的理想候选者,因为它们可以计算精确的可能性。然而,它们的感应偏见对明显的图形特征而不是语义上下文障碍障碍的OOD检测。在这项工作中,我们旨在将这些偏见与黑色素瘤的领域水平知识一起使用,以改善基于可能性的OOD检测恶性图像。我们令人鼓舞的结果表明,使用NFS检测黑色素瘤的可能性。我们通过使用基于小波的NFS,在接收器工作特性的曲线下,面积增加了9%。该模型需要较少的参数,以使其更适用于边缘设备。拟议的方法可以帮助医学专家诊断出皮肤癌患者并不断提高存活率。此外,这项研究为肿瘤学领域的其他领域铺平了道路,具有类似的数据不平衡问题\ footNote {代码可用:
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胰腺癌是与癌症相关死亡的全球主要原因之一。尽管深度学习在计算机辅助诊断和检测方法(CAD)方法中取得了成功,但很少关注胰腺癌的检测。我们提出了一种检测胰腺肿瘤的方法,该方法在周围的解剖结构中利用临床上的特征,从而更好地旨在利用放射科医生的知识,而不是其他常规的深度学习方法。为此,我们收集了一个新的数据集,该数据集由99例胰腺导管腺癌(PDAC)和97例没有胰腺肿瘤的对照病例组成。由于胰腺癌的生长模式,肿瘤可能总是可见为低音病变,因此,专家指的是二次外部特征的可见性,这些特征可能表明肿瘤的存在。我们提出了一种基于U-NET样深的CNN的方法,该方法利用以下外部次要特征:胰管,常见的胆管和胰腺以及处理后的CT扫描。使用这些功能,该模型如果存在胰腺肿瘤。这种用于分类和本地化方法的细分实现了99%的敏感性(一个案例)和99%的特异性,这比以前的最新方法的灵敏度增加了5%。与以前的PDAC检测方法相比,该模型还以合理的精度和较短的推理时间提供位置信息。这些结果提供了显着的性能改善,并强调了在开发新型CAD方法时纳入临床专家知识的重要性。
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计算光学成像(COI)系统利用其设置中的光学编码元素(CE)在单个或多个快照中编码高维场景,并使用计算算法对其进行解码。 COI系统的性能很大程度上取决于其主要组件的设计:CE模式和用于执行给定任务的计算方法。常规方法依赖于随机模式或分析设计来设置CE的分布。但是,深神经网络(DNNS)的可用数据和算法功能已在CE数据驱动的设计中开辟了新的地平线,该设计共同考虑了光学编码器和计算解码器。具体而言,通过通过完全可区分的图像形成模型对COI测量进行建模,该模型考虑了基于物理的光及其与CES的相互作用,可以在端到端优化定义CE和计算解码器的参数和计算解码器(e2e)方式。此外,通过在同一框架中仅优化CE,可以从纯光学器件中执行推理任务。这项工作调查了CE数据驱动设计的最新进展,并提供了有关如何参数化不同光学元素以将其包括在E2E框架中的指南。由于E2E框架可以通过更改损耗功能和DNN来处理不同的推理应用程序,因此我们提出低级任务,例如光谱成像重建或高级任务,例如使用基于任务的光学光学体系结构来增强隐私的姿势估计,以维护姿势估算。最后,我们说明了使用全镜DNN以光速执行的分类和3D对象识别应用程序。
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尽管有持续的改进,但降水预测仍然没有其他气象变量的准确和可靠。造成这种情况的一个主要因素是,几个影响降水分布和强度的关键过程出现在全球天气模型的解决规模以下。计算机视觉社区已经证明了生成的对抗网络(GAN)在超分辨率问题上取得了成功,即学习为粗图像添加精细的结构。 Leinonen等。 (2020年)先前使用GAN来产生重建的高分辨率大气场的集合,并给定较粗糙的输入数据。在本文中,我们证明了这种方法可以扩展到更具挑战性的问题,即通过使用高分辨率雷达测量值作为“地面真相”来提高天气预报模型中相对低分辨率输入的准确性和分辨率。神经网络必须学会添加分辨率和结构,同时考虑不可忽略的预测错误。我们表明,甘斯和vae-gan可以在创建高分辨率的空间相干降水图的同时,可以匹配最新的后处理方法的统计特性。我们的模型比较比较与像素和合并的CRP分数,功率谱信息和等级直方图(用于评估校准)的最佳现有缩减方法。我们测试了我们的模型,并表明它们在各种场景中的表现,包括大雨。
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即使多模式的多目标多目标进化算法(MMOEA)旨在找到良好的解决方案,分布在所有本地最佳近似值集的多模式多模式多目标优化问题(MMOP)中,发现发现的风险是,发现的一组是一组。解决方案无法平稳导航,因为该解决方案属于各种壁ni,从而减少了决策者的见解。为了解决此问题,提出了一个新的mmoeA:多模式的B \'Ezier进化算法(MM-BEZEA),该算法产生近似集,涵盖单个利基市场并表现出固有的决策空间平稳性,因为它们由B \'参数化。Ezier曲线。MM-BEZEA结合了最近引入的bezea和Mo-Hillvallea背后的概念,以找到所有本地最佳近似集。当用线性帕累托套件上的MMOP上的MMOEAS MO_RING_PSO_SCD和MO-HILLVALLEA进行基准测试时,发现MM-BEZEA在最佳的HyperVolume方面表现最好。
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信息性测量是获取有关未知状态信息的最有效方法。我们给出了一般目的动态编程算法的第一原理推导,通过顺序地最大化可能的测量结果的熵来返回一系列信息测量。该算法可以由自主代理或机器人使用,以确定最佳测量的位置,规划对应于信息序列的最佳信息序列的路径。该算法适用于具有连续或离散的状态和控制,以及随机或确定性的代理动态;包括马尔可夫决策过程。最近的近似动态规划和强化学习的结果,包括卷展栏和蒙特卡罗树搜索等在线近似,允许代理或机器人实时解决测量任务。由此产生的近最佳溶液包括非近视路径和测量序列,其通常可以优于超过,有时基本上使用的贪婪启发式,例如最大化每个测量结果的熵。这是针对全球搜索问题的说明,其中发现使用扩展本地搜索的在线规划来减少搜索中的测量数。
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